重金屬很多都具有顯著的生物毒性，特別是汞、鎘、鉛等。這類物質在水體中不能被微生物降解，在水體中發生各種形態的相互轉化和分散以及富集到生物體中。有些重金屬比如汞，在微生物的作用～F司‘以轉變成甲基汞，從而使其生物毒性加強。一些重金屬可以在動物體的肝臟和。腎臟等器官內積累，造成機體組織損傷。汞、鎘、鉛、鋅等親硫重金屬元素可以與人體某些組織的一些酶的巰基(一sH)有特別大的親和力，能抑制酶的活性從而影響機體的正常生理功能。水體中的重金屬，即使濃度小，也可在藻類和底泥中積累，被魚和貝類體表吸附，產生食物鏈濃縮，從而造成公害。水體中金屬元素有利或有害不僅取決于金屬元素的種類、理化性質，而且還取決于金屬元素的濃度及存在的價態和形態，即使有益的金屬元素濃度超過某一數值也會有劇烈的毒性，使動植物中毒，甚至死亡。
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